Luiz Carlos,
Eu nunca notei uma diferença muito grande entre as estimativas desses programas, mas de qualquer forma eu prefiro usar a estimativa do Mach3 porque é ele quem irá fazer uso do arquivo de corte, e ao meu ver tem a simulação que mais se aproxima da realidade.
Me causou um pouco de estranheza as diferenças citadas por voce, mas creio que pode ser alguma configuração de aceleração por exemplo, que pode estar dando esta diferença toda.