Alguns reparos em sua terminologia, visando utilizar a linguagem técnica correta:

O PC (desktop) possui uma porta paralela (LPT1, LPT2, ...), provida de pinos de entrada e saída. Assim, o que você chama de "portas da placas no eixos no mach3" deve chamar pinos da porta paralela. Cada pino da porta possui uma função (exemplo: sentido de rotação do motor do eixo X, passos do eixo X, ...), funções estas designadas pelo Mach3.
 

Boa tarde Pessoal, não entendo muito dessas CNC s e de duas configurações, comprei uma proxxon mf70 com Kit CNC faz muito tempo, e estava parada nem mesmo tive tempo de liga-la, agora estou com uns projetos e preciso dela, bom preciso eleger as portas da placas no eixos no mach3, seria isso? Fiz um esquema da ligação

Placa CNC MASTER LPTOP-05-1

Eixo Z - 2 Fios - Roxo e Cinza (Porta 6 e porta 7)
Eixo Y - 2 Fios - Verde e Azul  (Porta 4 e porta 5)
Eixo X - 2 Fios - Marrom e Amarelo (Porta 2 e Porta 3)

Teria que por Essas portas no Mach3? onde eu coloco?  Help me

Eixos Z - 2 Fios - Roxo e Cinza (Pino 6 e pino 7) - definidos no Mach3
Eixos Y - 2 Fios - Verde e Azul  (Pino 4 e pino 5) - definidos no Mach3
Eixos X - 2 Fios - Marrom e Amarelo (Pino 2 e Pino 3) - definidos no Mach3

Ground - Pinos 18 a 25.

A placa "CNC MASTER LPTOP-05-1" é uma placa isoladora, que deve ser conectada a uma porta paralela do PC (desktop): http://www.newhskstore.com.br/lptop-05.html