O Comprimento do parafuso não vai interferir neste caso pois a força de cisalhamento é no sentido radial dos mesmo. Comprimento interfere na resistência axial e no aperto.

Não garante...

Talvez usando um esquadro pequeno e verificando a perpendicularidade da broca em relação ao material, assim como se faz quando se passa um macho manual, mas mesmo assim é dificil...

O ideal é ter uma máquina que garanta isso.

Para acertas os furos certinhos, eu utilizei uma cantoneira de 3/8" e com 2 sargentos segurei ela na peça e furei.
Para quem precisa de uma dica eu fiz assim.
Obrigado